n.m. (du grec [endo-] = à l'intérieur ; et [styl-] = colonne, d'où objet en forme de tige).
Il est présent chez les Urocordés, Céphalocordés. Il est également appelé gouttière hypopharyngienne. C'est en effet une gouttière étroite et profonde, à bords épais, ciliés et glandulaires. L'endostyle sécrète un mucus qui agglomère les particules en suspension formant ainsi un cordon qui est acheminé jusqu'à l'œsophage.