n.m. (du grec [endo-] = à l'intérieur ; et [derma] = peau).
Chez l'embryon des Métazoaires, c'est le plus interne des 3 feuillets (ectoderme, mésoderme, endoderme), qui se met en place à la gastrulation. Assurant les fonctions nutritives chez l'embryon (ou assimilés), il donnera ensuite naissance aux organes internes.
Chez les Spongiaires (qui n'ont que deux couches cellulaires réelles), on parle de choanoderme.
Chez les Cnidaires (qui n’ont également que deux couches de cellules séparées par la mésoglée) l’endoderme est l’ensemble de la couche de cellules qui constitue la paroi gastrique interne.
Chez les végétaux, il s'agit de la plus interne partie du cortex (écorce) des jeunes racines et tiges, où il joue principalement un rôle protecteur. Il évoluera avec l'âge du végétal.
